Shifu annonce à Po qu'il doit devenir le nouveau Chef Spirituel, et ainsi laisser sa place à un autre Dragon Guerrier. Cette nouvelle ne plaît pas du tout au panda, qui s'épanouissait dans ce rôle de protecteur. Avant de léguer son Bâton de la Sagesse à un autre, il doit accomplir une dernière mission, soit empêcher la Caméléonne, une sorcière pouvant se métamorphoser en n'importe quelle créature, d'étendre son pouvoir jusqu'à la vallée de la Paix. Il sera aidé dans sa tâche par Zhen, une renarde rusée et une habile voleuse, qui sait où se cache le lézard machiavélique.
Alors que la jungle chinoise est envahie par des méchants léopards, les animaux décident de demander de l'aide à un guerrier prophétique censé les défendre. Mais l'élu s'avère être un panda paresseux et maladroit. Commence alors une formation intensive et rocambolesque pour le transformer en un maître incontesté du kung-fu.