Fils de l'acteur Ed Begley ( star de la série Bonanza), Ed Begley Jr. commence sa carrière à la fin des années 60. C'est en 1982 qu'il se fait véritablement connaître à travers Officier et gentleman ( Taylor Hackford) et surtout, via la série St Elsewhere (1982/1988) qui lui permet d'obtenir 6 nominations à l'Emmy.
Si sa carrière au cinéma est parsemée d'apparitions notables mais anecdotiques, l'acteur peut compter à sa filmographie des films aussi différents que Voyageur malgré lui, Spinal Tap, Batman Forever ou encore Délire Express. En revanche, on le connaît très bien à la télévision, notamment lors des premières saisons de Six Feet Under où il interprète l'amant de Ruth Fisher, personnage qui va "réveiller" cette même Ruth à la vie. Puis il s'est produit sur scène dans la première sur la côte Ouest de la pièce de David Mamet «Cryptogram» au Geffen Playhouse, dans un rôle qu'il avait auparavant joué à Boston puis à New York.
A son actif en tant que réalisateur, Ed Begley, Jr. a par ailleurs mis en scène plusieurs épisodes de la série New York Police Blues. Et new York, Woody Allen connait bien puisque le réalisateur l'invite à intégrer le casting de son crû 2009 : Whatever works.
