Fils de fermier, un jeune garçon rêve de posséder un cheval. Son père cède, mais n'approuve pas le choix de son fils, qui a jeté son dévolu sur une pouliche, née d'une jument caractérielle. Flicka a hérité de la beauté et la fierté de sa mère. Avec l'amour de son jeune cavalier, elle acceptera l'homme comme un ami.
Thunderhead, le fils de Flicka est devenu un superbe étalon sauvage. Il s'est enfui dans les collines avec Joyau, une belle jument appartenant à Cary. Au ranch, on organise une expédition pour les retrouver. Ken, propriétaire de Thunderhead, et Carey réussiront-ils à ramener les chevaux sains et saufs ?
Le jeune Ken McLaulin et ses parents s'occupent de Thunderhead, un jeune cheval sauvage au moins aussi rebelle que sa légendaire mère, Flicka. Ken parvient à apprivoiser l'animal. Rapidement, Thunderhead devient un cheval très doué et et performant. Ses talents attirent l'attention d'un entrepreneur qui voit en lui un futur cheval de course. Mais Ken est partagé entre son attachement pour son cheval et l’opportunité de lui rendre sa liberté.