Pendant ses études à l'école d'art, Ishizuka réalisa plusieurs courts métrages d'animation pour son propre plaisir, souvent accompagnés de musique. L'un de ces films, Gravitation, qui fut par la suite présenté au Festival international du court-métrage de Téhéran en 2005, attira l'attention à la fois du géant de la radiodiffusion japonaise NHK et de Madhouse. NHK prit rapidement contact avec Atsuko pour lui proposer d'animer un segment de clip musical pour le programme populaire et de longue durée Minna no Uta (Les Chansons de tous), conçu pour mettre en avant les animateurs et musiciens indépendants prometteurs. Cependant, à ce moment-là, Ishizuka avait déjà été engagée par Madhouse en tant qu'assistante de production, et estimant qu'il ne serait pas approprié d'accepter du travail en freelance en dehors du studio, elle refusa. Néanmoins, l'équipe de Minna no Uta n'était pas disposée à abandonner, et elle demanda à Madhouse de prendre en charge le projet de clip musical avec Ishizuka comme réalisatrice. Le studio accepta, et en 2004, Atsuko gravit les échelons pour son premier film professionnel, The Moon Waltz.