Cynthia Nixon a incarné Eleanor Roosevelt dans le téléfilm Warm Springs face à Kenneth Branagh dans le rôle de Franklin Roosevelt. En 2004, elle a été la vedette de la mini-série Tanner on Tanner, réalisée par Robert Altman et écrite par Garry Trudeau. Elle a été aussi la guest star d'Urgences et de Dr. House et a joué dans le téléfilm Papa's Angels. En 2008, elle joue dans Sex and the city, le film adapté de la série.
Cynthia Nixon a reçu à 14 ans un Theater World Award pour son premier rôle au théâtre dans The Philadelphia Story par Ellis Rabb. A 15 ans, elle était dirigée par Louis Malle dans le rôle-titre de Lydie Breeze de John Guare. A 18 ans, elle jouait 2 pièces à Broadway, Hurly Burly de David Rabe et The Real Thing de Tom Stoppard, mises en scène par Mike Nichols. Elle a joué le rôle de Mary Haines à Broadway dans la reprise de The Women le rôle-titre de The Primeof Miss Jean Brodie off-Broadway. En 2006, elle a joué la pièce de David Lindsay-Abair, Rabbit Hole.En 2008, le rôle qui l'a fait tconnaître du grand public est porté sur grand écran. Sex and the city - le film sort en mai de cette année-là.