J.E. Freeman (né le 2 février 1946) est un acteur américain. Il a travaillé comme acteur de caractère, souvent distribué dans des rôles de dur à cuire et de figures d'autorité. Son premier rôle au cinéma remonte au début des années 80 avec le film d'action Un œil pour un œil, où il joue un dépanneur qui se dispute avec Chuck Norris.
Il est particulièrement connu pour ses rôles de personnages menaçants : le gangster malfaisant Marcelles Santos dans Wild at Heart de David Lynch, l'terrifiant Eddie Dane, tueur à gages férocement gay dans Miller's Crossing, et l'infâme scientifique Mason Wren dans Alien Resurrection. Autres apparitions notables dans : Ruthless People, Jeux de patriotes, Copycat et Go.
Il est ouvertement gay. En 2009, il a publié une lettre au rédacteur en chef sur sfgate.com, détaillant ses souvenirs des émeutes de Stonewall en 1969.