Il entame les années 1990 avec son album H et la chanson "Temps à nouveau" qui sera vendue à plus de 200 000 exemplaires. Il prend la route et écume nombreuses salles françaises devant un public conquis. Viendra en 1997 l'album Stockholm, sur lequel il signe deux titres en collaboration avec Barbara. Puis, il revient en 2001 avec un cinquième opus Comme un Accord, au répertoire pop, rock et électro.
Le travail d'Aubert continue de se peaufiner avec les années et les collaborations, comme avec Paul Personne ou Barbara pour laquelle il écrit deux titres en 1996, et qui chantera avec lui sur son album Stockholm en 1997.
De concerts en concerts, du Cirque d'Hiver à l'Olympia, en passant par le Stade de France (en première partie des Stones !), Jean-Louis Aubert est parvenu, avec les années à s'affirmer en tant qu'artiste solo, et à se débarrasser de son étiquette Téléphone.
Il est aujourd'hui une valeur sûre de la chanson française, avec une carrière riche de 25 années de créations et une image d'antistar naturelle, généreuse et sympathique.
Son dernier album, Idéal Standard, est sorti en 2005, le chanteur entame une tournée dans toute la France. Cette dernière est un triomphe et dure plus de ans avec une version accoustisque. En 2009, le chanteur revient avec l'opus Premières Prises. une compliation acoustique de ses principaux titres. Il faut attendre la rentrée 2010 et le mois de novembre pour que revienne Aubert avec un nouveau répertoire : Roc éclair devient alors son 6ème opus studio.
