Khan est née dans le district de Dera Ismail Khan, tehsil Tank (jusqu'en 1992), dans la région du N.W.F.P., devenue province du Khyber-Pachtounkhoua au Pakistan. Son père, Rehmat Khan, était pakistanais d'ethnie pachtoune, tandis que sa mère, Anna Rehmat, était d'origine anglaise mais s'était installée au Pakistan. Elle est également la petite-nièce du Nawab de Tank. Son père travaillait pour l'aviation militaire pakistanaise, et la famille devait déménager presque tous les deux ans selon les affectations professionnelles. C'est pour cette raison qu'elle a déclaré lors d'une interview n'avoir pas eu d'amis d'enfance de longue durée. Marina Khan a fait ses débuts dans un drame PTV en l'honneur de Rashid Minhas Shaheed, héros national pakistanais de la Guerre indo-pakistanaise de 1971. Elle a ensuite connu son véritable succès grâce à la série dramatique Tanhaiyaan en 1985. Marina Khan est devenue célèbre avec Tanhaiyaan, qui a remporté un succès considérable auprès du public pakistanais. Par la suite, Marina s'est orientée vers la réalisation et la production cinématographique dans sa carrière, et a également animé sa propre émission culinaire.
Actuellement, elle réside à Karachi et reste représentante de bonne volonté du Fonds mondial pour la nature (WWF). Elle a animé l'émission Marina Mornings sur ARY Digital. En 2016, elle a participé au court-métrage Lala Begum de Mehreen Jabbar. Le film a été présenté au Festival international du cinéma sud-asiatique Mosaic le 6 août 2016 sous la bannière Zeal for Unity. Elle a ensuite fait une apparition dans Punjab Nahi Jaongi (2017) et a joué des rôles récurrents dans Na Maloom Afraad 2 (2018) et Parwaaz Hai Junoon (2018). Cette même année, elle a participé au téléfilm d'Aïd Hum Chale Aaye de Mehreen Jabbar. À la télévision, Khan reste actuellement active dans l'industrie télévisuelle ourdoue, apparaissant dans diverses séries dramatiques. Ses apparitions les plus récentes incluent Jackson Heights (2014), Kaif-e-Baharan (2018), Noor-ul-Ain (2018), Qaid (2018), Dil Kiya Karey (2018) et Bandish (2019).